Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkn1bP46414 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms