Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms