Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gdf5P43027 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms