Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tac1P41539 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms