Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
VhlP40338 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VhlP40338 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VhlP40338 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VhlP40338 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms