Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps26aP40336 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps26aP40336 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms