Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ThpoP40226 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms