Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3rP40223 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms