Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd1P40201 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms