Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik2P39087 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik2P39087 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grik2P39087 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms