Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms