Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpargP37238 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpargP37238 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PpargP37238 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms