Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RetP35546 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RetP35546 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetP35546 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetP35546 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RetP35546 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RetP35546 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RetP35546 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms