Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab23P35288 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms