Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn11P35235 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn11P35235 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms