Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms