Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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