Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms