Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tacr1P30548 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms