Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc1P29341 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms