Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcdP28867 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms