Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a9P28571 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms