Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apex1P28352 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms