Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb3P28231 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms