Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CebpbP28033 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms