Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Xrcc5P27641 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xrcc5P27641 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms