Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms