Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChgaP26339 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms