Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms