Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd12P23812 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd12P23812 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms