Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkchP23298 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkchP23298 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms