Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PparaP23204 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PparaP23204 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PparaP23204 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PparaP23204 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms