Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx3P23198 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms