Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RarbP22605 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RarbP22605 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RarbP22605 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RarbP22605 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RarbP22605 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms