Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clk1P22518 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clk1P22518 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms