Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms