Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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