Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TP20293 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TP20293 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TP20293 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TP20293 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TP20293 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms