Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VimP20152 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VimP20152 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VimP20152 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VimP20152 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VimP20152 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VimP20152 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VimP20152 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VimP20152 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VimP20152 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VimP20152 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms