Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a1P19437 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a1P19437 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms