Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RargP18911 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RargP18911 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RargP18911 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RargP18911 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RargP18911 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms