Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa-rs1P17533 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa-rs1P17533 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Defa-rs1P17533 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa-rs1P17533 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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