Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SptbP15508 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SptbP15508 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SptbP15508 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SptbP15508 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SptbP15508 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms