Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prph2P15499 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms