Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd44P15379 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms