Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Irf1P15314 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Irf1P15314 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf1P15314 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Irf1P15314 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Irf1P15314 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Irf1P15314 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Irf1P15314 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irf1P15314 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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