Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpsaP14206 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms