Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt1P13864 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms