Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fv4P11370 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms