Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP11369 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP11369 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PolP11369 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PolP11369 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PolP11369 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP11369 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP11369 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP11369 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms